98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1009 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  100 
 
 
305 aa  627  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  80.07 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  32.48 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  32.85 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  28.17 
 
 
328 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  30.53 
 
 
347 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  30.18 
 
 
280 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  32.59 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
401 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  30 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.78 
 
 
326 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  26.02 
 
 
273 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  28.57 
 
 
336 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
401 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  27.6 
 
 
1014 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
331 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  31.87 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.28 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  27.45 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  28.52 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  31.64 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.41 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.94 
 
 
337 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  30.28 
 
 
401 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.68 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  29.41 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  23.36 
 
 
697 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.95 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.94 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
282 aa  95.9  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  25.62 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.95 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  27.46 
 
 
315 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.64 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  26.36 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.92 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  26.74 
 
 
338 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  26.74 
 
 
338 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.74 
 
 
338 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.64 
 
 
274 aa  89  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  23.08 
 
 
338 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.74 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.64 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.92 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  27.69 
 
 
242 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  27.14 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.54 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.1 
 
 
336 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
354 aa  85.9  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.67 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  25 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.67 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  26.77 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.25 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.63 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  27.2 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3270  glycosyl transferase family 8  24.57 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.35 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  25.53 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  21.98 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  27.92 
 
 
602 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
630 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  22.19 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0711  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  27.53 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  21.54 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  21.22 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  21.22 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  21.22 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  21.32 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  21.32 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0994  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.58 
 
 
759 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.624995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.64 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  27.39 
 
 
610 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.27 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  22.74 
 
 
371 aa  62.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  28.48 
 
 
615 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  25 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  25.19 
 
 
167 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2334  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 
317 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  24.16 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0399  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  25.42 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76484  glycogenin glucosyltransferase  24.28 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3933  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3139  glycosyl transferase family 8  24.58 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>