More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0997 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 126 aa  259  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  45 
 
 		 271 aa  103  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  49.49 
 
 		 831 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  44.44 
 
 		 264 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  48.98 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.32 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 223 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  46.53 
 
 		 425 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  47.71 
 
 		 1402 aa  90.1  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  45.37 
 
 		 232 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  40.17 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  49.51 
 
 		 489 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  44.55 
 
 		 1493 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  50.55 
 
 		 557 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  40.91 
 
 		 490 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  46.23 
 
 		 684 aa  87.8  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  42.5 
 
 		 193 aa  87.8  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  45.65 
 
 		 305 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  53.41 
 
 		 252 aa  86.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.39 
 
 		 490 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.44 
 
 		 341 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 393 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.14 
 
 		 318 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.61 
 
 		 346 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  47.42 
 
 		 552 aa  84  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  42.06 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  45 
 
 		 2413 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  44.09 
 
 		 685 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  44.79 
 
 		 839 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  47.73 
 
 		 961 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  42.42 
 
 		 789 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.22 
 
 		 1344 aa  80.9  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  41.03 
 
 		 256 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  43.4 
 
 		 241 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.1 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.32 
 
 		 416 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  40.71 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  43.88 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  49.41 
 
 		 850 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 380 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.7 
 
 		 359 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.52 
 
 		 528 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.35 
 
 		 343 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 		 303 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 		 448 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.05 
 
 		 235 aa  76.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.79 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  42 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  45.45 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1002 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  47.78 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  45.35 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  43.68 
 
 		 731 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1796 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.11 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  44.87 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  44.87 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  44.87 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  44.87 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  46.75 
 
 		 746 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  44.33 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 		 1032 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  44.33 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  35.09 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1037 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 		 1430 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.59 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  39.81 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  48.28 
 
 		 1910 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  43.68 
 
 		 376 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  50 
 
 		 1877 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  41.67 
 
 		 338 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  44.33 
 
 		 509 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  44.33 
 
 		 509 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  43.37 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  50 
 
 		 399 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  41.84 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  39.6 
 
 		 365 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.17 
 
 		 357 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  43.68 
 
 		 376 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  44.83 
 
 		 464 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36.54 
 
 		 838 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.43 
 
 		 278 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  43.21 
 
 		 249 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  44.87 
 
 		 586 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  40.68 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.86 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  41.86 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  43.48 
 
 		 839 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  41.86 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  41.24 
 
 		 482 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.84 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  34.43 
 
 		 763 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.18 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 1012 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>