39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0973 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  100 
 
 		 362 aa  752    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  69.31 
 
 		 281 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  69 
 
 		 274 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  67.53 
 
 		 274 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  67.9 
 
 		 274 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  67.9 
 
 		 274 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  67.16 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  67.16 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  67.16 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  67.9 
 
 		 274 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  54.96 
 
 		 285 aa  301  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  45.72 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  35.16 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  34.94 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  36.82 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  37.55 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  36.3 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  33.7 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  54.7 
 
 		 123 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  34.36 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  51.75 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  34.57 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  47.47 
 
 		 187 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  29 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  51.06 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1124  hypothetical protein  28.95 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0327525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  35.04 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  37.04 
 
 		 92 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  42.11 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  37.62 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  61.36 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  39.6 
 
 		 286 aa  54.3  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  61.54 
 
 		 271 aa  53.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  35.35 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  34.34 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  57.78 
 
 		 132 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  36.84 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  50 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>