207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0955 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  100 
 
 		 166 aa  336  7e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  89.7 
 
 		 166 aa  306  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  83.03 
 
 		 166 aa  292  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  68.48 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  67.47 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  66.06 
 
 		 166 aa  226  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  60 
 
 		 166 aa  210  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  54.94 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  55.21 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  58.02 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  56.79 
 
 		 165 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  57.32 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  56.36 
 
 		 166 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  56.36 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  55.56 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  55.76 
 
 		 166 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  55.76 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  55.15 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  59.62 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  55.49 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  57.67 
 
 		 164 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  55.21 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  53.99 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  53.37 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  57.32 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  61.21 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  54.66 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  51.52 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  53.42 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  52.44 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  54.6 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  52.15 
 
 		 163 aa  168  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  51.53 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.85 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  49.69 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  51.23 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  50.31 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  50.33 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  51.52 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  51.52 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  53.42 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  47.85 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  47.53 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  53.05 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  46.34 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  49.08 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  47.88 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  45.4 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  46.34 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  45.68 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  48.17 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  44.25 
 
 		 182 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  44.07 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  44.89 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  52.15 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  43.56 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  40.8 
 
 		 182 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.75 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  45.68 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.24 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  43.11 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  39.88 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  40 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  41.92 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  44.7 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.17 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  40.12 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  41.67 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  36.14 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.76 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  42.31 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  37.42 
 
 		 392 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  41.22 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  44.27 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  36.81 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  43.07 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  36.2 
 
 		 221 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  38.46 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  36.81 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  46.15 
 
 		 140 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  32.73 
 
 		 179 aa  97.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  32.73 
 
 		 179 aa  97.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  43.85 
 
 		 140 aa  97.1  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  34.55 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  37.35 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.08 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  35.98 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  34.22 
 
 		 237 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.59 
 
 		 237 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  34.91 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  40.3 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  43.85 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  43.08 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  33.71 
 
 		 202 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>