More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0921 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  100 
 
 
317 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  83.07 
 
 
317 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  76.66 
 
 
317 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  70.23 
 
 
311 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  68.61 
 
 
311 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  69.13 
 
 
309 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  69.77 
 
 
327 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  68.61 
 
 
309 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  67.43 
 
 
310 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  63.73 
 
 
308 aa  377  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  63.43 
 
 
310 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.75 
 
 
308 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.81 
 
 
308 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  63.31 
 
 
308 aa  358  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  59.09 
 
 
327 aa  358  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  59.42 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.14 
 
 
308 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  55.31 
 
 
311 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  62.09 
 
 
309 aa  354  7.999999999999999e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  59.8 
 
 
307 aa  354  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.96 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.96 
 
 
312 aa  352  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.96 
 
 
309 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  60.83 
 
 
319 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  58.63 
 
 
309 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  60.06 
 
 
320 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  58.31 
 
 
307 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  64.42 
 
 
309 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  61.11 
 
 
311 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  60.06 
 
 
313 aa  349  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.12 
 
 
312 aa  348  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.93 
 
 
310 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  58.17 
 
 
304 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  63.46 
 
 
309 aa  347  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  60.06 
 
 
311 aa  346  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  58.84 
 
 
309 aa  345  4e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.39 
 
 
308 aa  345  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  58.12 
 
 
322 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  60.33 
 
 
310 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.11 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  59.28 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  58.96 
 
 
311 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  55.99 
 
 
310 aa  342  5.999999999999999e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  59.09 
 
 
320 aa  342  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  57.46 
 
 
328 aa  341  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  59.6 
 
 
316 aa  341  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.35 
 
 
339 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  62.21 
 
 
309 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  62.21 
 
 
309 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.74 
 
 
320 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  57.47 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  58.63 
 
 
309 aa  339  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  57.14 
 
 
318 aa  338  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  59.35 
 
 
308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  60.71 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  56.35 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  54.4 
 
 
304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  60.59 
 
 
311 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.78 
 
 
309 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.12 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  55.7 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  58.03 
 
 
309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  57.93 
 
 
320 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  57.98 
 
 
327 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  58.44 
 
 
311 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  58.44 
 
 
330 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  58.96 
 
 
322 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  57.65 
 
 
327 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.56 
 
 
310 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  58.77 
 
 
321 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  56.69 
 
 
316 aa  328  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  53.42 
 
 
304 aa  328  6e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.1 
 
 
309 aa  328  9e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  61.04 
 
 
310 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  61.04 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  55.23 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.03 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  58.31 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  59.42 
 
 
311 aa  326  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  60.26 
 
 
310 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  59.09 
 
 
311 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  57.65 
 
 
319 aa  325  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  58.5 
 
 
310 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  54.55 
 
 
311 aa  325  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  56.31 
 
 
311 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  57.28 
 
 
311 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  53.92 
 
 
310 aa  323  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  53.92 
 
 
310 aa  323  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  57.33 
 
 
332 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  58.77 
 
 
320 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  56.54 
 
 
324 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  59.74 
 
 
331 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  55.7 
 
 
328 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  55.63 
 
 
322 aa  321  8e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  55.99 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  57.43 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  61.04 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  58.44 
 
 
323 aa  320  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  56.54 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  58.31 
 
 
322 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>