30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0891 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  79.23 
 
 		 397 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  792    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  85.17 
 
 		 391 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  68.64 
 
 		 391 aa  557  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  67.53 
 
 		 391 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  63.85 
 
 		 404 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  59.69 
 
 		 403 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  55.61 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  51.53 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  48.98 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  49.53 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  49.49 
 
 		 405 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  50.89 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  50.38 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  85.51 
 
 		 145 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  35.88 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  33.94 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  32.12 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  33.71 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  29.65 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  28.13 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  33.21 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  65.15 
 
 		 92 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  26.02 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  23.47 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  25.75 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  22.29 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  43.75 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  26.08 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>