More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0855 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  100 
 
 
503 aa  1021  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  58.45 
 
 
503 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  56.31 
 
 
495 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  59.62 
 
 
516 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.8172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  45.64 
 
 
465 aa  411  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  44.03 
 
 
436 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  38.84 
 
 
400 aa  321  1e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.40238e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  43.8 
 
 
412 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  26.82 
 
 
475 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  23.74 
 
 
418 aa  112  1e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  32.17 
 
 
407 aa  112  2e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  32.66 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  29.96 
 
 
419 aa  93.2  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  24.41 
 
 
446 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  31.25 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  21.52 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  22.24 
 
 
429 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  27.55 
 
 
440 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  29.15 
 
 
422 aa  86.3  1e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  31.33 
 
 
441 aa  85.9  2e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  30.22 
 
 
416 aa  85.1  3e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  25.86 
 
 
428 aa  84.3  4e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  34.69 
 
 
438 aa  84  5e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  34.69 
 
 
438 aa  84.3  5e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  36.84 
 
 
449 aa  82.4  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  28.3 
 
 
370 aa  82.4  2e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  27.31 
 
 
362 aa  81.6  3e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  27.31 
 
 
362 aa  81.6  3e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  34.03 
 
 
304 aa  81.3  4e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  36.72 
 
 
372 aa  80.5  6e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  30.34 
 
 
377 aa  80.1  8e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  30.34 
 
 
377 aa  80.1  8e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  36.72 
 
 
372 aa  79.7  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  36.72 
 
 
373 aa  79.7  1e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  33.1 
 
 
388 aa  79  2e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.73 
 
 
430 aa  79  2e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  26.85 
 
 
362 aa  78.6  3e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  26.85 
 
 
362 aa  78.2  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  29.66 
 
 
344 aa  78.2  4e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  36.09 
 
 
478 aa  78.2  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.99 
 
 
387 aa  77.4  5e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  34.69 
 
 
484 aa  77  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.01 
 
 
397 aa  77  7e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  28.17 
 
 
382 aa  77  8e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  35.11 
 
 
474 aa  76.6  1e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  34.59 
 
 
464 aa  76.3  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  35.34 
 
 
453 aa  76.3  1e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  34.59 
 
 
471 aa  75.9  2e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  25.69 
 
 
377 aa  75.5  2e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  29.51 
 
 
314 aa  74.7  3e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.82 
 
 
303 aa  75.1  3e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  36.36 
 
 
500 aa  75.1  3e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.65 
 
 
428 aa  74.7  3e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  34.23 
 
 
247 aa  74.3  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  21.79 
 
 
397 aa  74.3  5e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  30.22 
 
 
434 aa  73.6  8e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  33.61 
 
 
319 aa  73.6  9e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.26 
 
 
295 aa  72.8  2e-11  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  21.51 
 
 
456 aa  72  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  31.58 
 
 
420 aa  72.4  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  34.23 
 
 
241 aa  72.4  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34852e-12 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  21.31 
 
 
456 aa  71.6  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  21.31 
 
 
456 aa  71.6  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  35.35 
 
 
417 aa  71.6  3e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  35.56 
 
 
382 aa  71.2  4e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  33.61 
 
 
369 aa  71.2  4e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  31.54 
 
 
352 aa  70.9  5e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  30.72 
 
 
394 aa  70.9  6e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.37 
 
 
366 aa  70.5  7e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  31.11 
 
 
396 aa  69.7  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  36.84 
 
 
204 aa  69.3  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.22737e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  35.11 
 
 
412 aa  69.7  1e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  33.33 
 
 
509 aa  68.9  2e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.07 
 
 
387 aa  68.6  2e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  28.79 
 
 
432 aa  68.2  3e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.7 
 
 
376 aa  68.2  3e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  31.58 
 
 
477 aa  68.6  3e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  29.69 
 
 
417 aa  68.2  3e-10  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.47 
 
 
391 aa  67.8  4e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  26.11 
 
 
374 aa  67.8  5e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.32 
 
 
375 aa  67.4  6e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
204 aa  67.4  6e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
204 aa  67  7e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.76143e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  33.33 
 
 
204 aa  67  7e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.86273e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  33.33 
 
 
204 aa  67  7e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  32.28 
 
 
251 aa  67  8e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  33.61 
 
 
318 aa  67  8e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  36.36 
 
 
447 aa  66.6  9e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  34.21 
 
 
204 aa  67  9e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.54274e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  27.1 
 
 
436 aa  66.2  1e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  28.57 
 
 
369 aa  66.2  1e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  34.21 
 
 
204 aa  66.6  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.46797e-10  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  22.52 
 
 
455 aa  66.2  1e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  33.6 
 
 
240 aa  66.2  1e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  27.1 
 
 
436 aa  65.9  1e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  30.82 
 
 
397 aa  65.9  2e-09  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  35.48 
 
 
530 aa  65.5  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  34.21 
 
 
204 aa  65.5  2e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.61202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  28.57 
 
 
413 aa  65.1  2e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  34.21 
 
 
204 aa  64.7  3e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.18576e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>