205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0818 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  100 
 
 
166 aa  345  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  84.34 
 
 
166 aa  294  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  81.93 
 
 
166 aa  289  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  79.52 
 
 
166 aa  285  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  78.31 
 
 
166 aa  280  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  70.3 
 
 
165 aa  251  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  67.88 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  68.48 
 
 
165 aa  241  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  55.42 
 
 
166 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  56.63 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  55.42 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.02 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  52.44 
 
 
166 aa  170  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  50.91 
 
 
166 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  50.3 
 
 
166 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  53.29 
 
 
164 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  53.33 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  49.09 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  50.3 
 
 
168 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  51.2 
 
 
165 aa  155  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  48.8 
 
 
166 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  52.9 
 
 
158 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  48.12 
 
 
166 aa  154  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  51.22 
 
 
172 aa  153  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  50 
 
 
168 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  48.8 
 
 
166 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  47.27 
 
 
166 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  48.19 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  47.24 
 
 
173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  48.8 
 
 
164 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.4 
 
 
167 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  48.5 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.83 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  43.9 
 
 
166 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  45.34 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.9 
 
 
165 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  48.5 
 
 
165 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  47.56 
 
 
168 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  44.51 
 
 
167 aa  141  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  43.53 
 
 
184 aa  141  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  45.45 
 
 
170 aa  141  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  43.29 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.72 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  46.67 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  44.85 
 
 
170 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  44.85 
 
 
170 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  47.27 
 
 
164 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  42.17 
 
 
163 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  44.32 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.24 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  41.72 
 
 
167 aa  134  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.95 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  49.08 
 
 
169 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  48.17 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.23 
 
 
184 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  42.26 
 
 
185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  40 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  39.63 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  40.99 
 
 
166 aa  125  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  44.91 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.13 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  39.29 
 
 
228 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  39.88 
 
 
184 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.38 
 
 
233 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  42.59 
 
 
216 aa  103  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  39.49 
 
 
178 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  42.68 
 
 
178 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  42.04 
 
 
178 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  46.51 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.88 
 
 
179 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  36.87 
 
 
263 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  38.36 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  37.11 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  38.99 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  38.46 
 
 
221 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.18 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.31 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  43.75 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  39.88 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  39.13 
 
 
183 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  40.48 
 
 
202 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  44.53 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  46.46 
 
 
140 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  38.46 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  38.51 
 
 
183 aa  94.4  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  40.23 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  38.51 
 
 
183 aa  94.4  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  47.66 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  45.31 
 
 
140 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  40 
 
 
215 aa  94  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  39.88 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  37.16 
 
 
194 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>