274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0789 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  47.54 
 
 		 813 aa  711    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  58.54 
 
 		 809 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  47.69 
 
 		 925 aa  749    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  57.33 
 
 		 786 aa  909    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 795 aa  1649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  65.09 
 
 		 794 aa  1070    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  47.54 
 
 		 813 aa  711    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  69.03 
 
 		 799 aa  1120    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  49.34 
 
 		 815 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  59.59 
 
 		 788 aa  965    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  49.74 
 
 		 785 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  67.4 
 
 		 796 aa  1104    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  58.92 
 
 		 784 aa  966    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  57.12 
 
 		 768 aa  927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  58.54 
 
 		 809 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  44.81 
 
 		 971 aa  694    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  42.84 
 
 		 796 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  41.05 
 
 		 778 aa  612  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.62 
 
 		 998 aa  561  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  33.67 
 
 		 920 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  34.31 
 
 		 455 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  62.5 
 
 		 154 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  64.1 
 
 		 195 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 479 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 479 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.59 
 
 		 479 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.45 
 
 		 479 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.63 
 
 		 485 aa  138  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 		 485 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 463 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  26.12 
 
 		 654 aa  98.6  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  31.07 
 
 		 443 aa  93.6  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  50 
 
 		 279 aa  93.2  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.07 
 
 		 551 aa  92  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  23.23 
 
 		 473 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  27.16 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  25.2 
 
 		 451 aa  91.3  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  28.62 
 
 		 652 aa  89.7  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.32 
 
 		 630 aa  89.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  34.68 
 
 		 456 aa  89.4  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.8 
 
 		 462 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 475 aa  88.2  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.99 
 
 		 773 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  33.96 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  34.32 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.6 
 
 		 558 aa  83.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 		 583 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  32.95 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  34.71 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.62 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.45 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  36.48 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  24.09 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  24.61 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  24.64 
 
 		 993 aa  80.5  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.37 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  29.89 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  35.33 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  23.8 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.85 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  25.96 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  23.51 
 
 		 1043 aa  77.4  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  28 
 
 		 509 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  34.57 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  33.51 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  23.49 
 
 		 560 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.82 
 
 		 967 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 581 aa  76.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  28.01 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.66 
 
 		 1077 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  29.53 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  34.07 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  26.17 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.69 
 
 		 815 aa  74.3  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  27.96 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  37.12 
 
 		 629 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  26.99 
 
 		 536 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  25.82 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 979 aa  73.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  23.69 
 
 		 398 aa  73.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.63 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  29.49 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  34.21 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  26.78 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  35.42 
 
 		 531 aa  72  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  25.78 
 
 		 1017 aa  71.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>