38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0766 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  53.85 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  63.7 
 
 		 174 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  56.52 
 
 		 182 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  55.7 
 
 		 145 aa  158  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  50.68 
 
 		 174 aa  148  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  43.02 
 
 		 177 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  48.51 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  51.22 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  50.88 
 
 		 170 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  47.06 
 
 		 135 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  48.76 
 
 		 171 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  34.2 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  29.75 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  32.39 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  34.1 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  35.44 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  45.83 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  37.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  34.07 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  33.59 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  43.53 
 
 		 183 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  42.5 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  32.21 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  33.08 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  26.79 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  41.54 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  29.89 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  38.53 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  47.46 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  32.14 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  24.75 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  32.58 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  32.58 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  24.32 
 
 		 165 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  28.04 
 
 		 329 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  24.74 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  24.76 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>