More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0699 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  77.03 
 
 		 296 aa  471  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  78.72 
 
 		 296 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  78.38 
 
 		 296 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  76.01 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  72.64 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  72.64 
 
 		 297 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  48.24 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  50.72 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50.9 
 
 		 290 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50.54 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 290 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  48.92 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 294 aa  262  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 298 aa  258  9e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 294 aa  256  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  48.35 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  47.64 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  44.12 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  43.92 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  46.32 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  43.92 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.89 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  43.48 
 
 		 291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.72 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  44.26 
 
 		 298 aa  244  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  44.75 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  45.95 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  45.95 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.93 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>