239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0683 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  78.09 
 
 		 922 aa  1489    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.6 
 
 		 911 aa  897    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.3 
 
 		 908 aa  904    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.81 
 
 		 923 aa  1194    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.71 
 
 		 912 aa  895    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.56 
 
 		 922 aa  901    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 922 aa  1897    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.81 
 
 		 910 aa  907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.32 
 
 		 914 aa  895    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  69.41 
 
 		 922 aa  1300    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  61.77 
 
 		 922 aa  1154    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.53 
 
 		 910 aa  897    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.63 
 
 		 908 aa  913    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.82 
 
 		 922 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.82 
 
 		 922 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.71 
 
 		 922 aa  489  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.64 
 
 		 916 aa  479  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.31 
 
 		 919 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.87 
 
 		 920 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.17 
 
 		 920 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.76 
 
 		 946 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.72 
 
 		 906 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 920 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 		 933 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.51 
 
 		 896 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 		 947 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.32 
 
 		 936 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 933 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.51 
 
 		 938 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 928 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.63 
 
 		 939 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.95 
 
 		 929 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.05 
 
 		 929 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 929 aa  415  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.22 
 
 		 945 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 		 928 aa  412  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.85 
 
 		 929 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.18 
 
 		 970 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 		 926 aa  412  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 		 982 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.23 
 
 		 946 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.27 
 
 		 926 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 947 aa  409  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.69 
 
 		 926 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 932 aa  405  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.41 
 
 		 930 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.12 
 
 		 920 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 949 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.2 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.09 
 
 		 957 aa  399  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.74 
 
 		 949 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.41 
 
 		 921 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.63 
 
 		 949 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.12 
 
 		 934 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33 
 
 		 933 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.52 
 
 		 929 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.78 
 
 		 957 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.22 
 
 		 951 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.88 
 
 		 950 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.1 
 
 		 1018 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.81 
 
 		 938 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.44 
 
 		 903 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.16 
 
 		 946 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.16 
 
 		 946 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.47 
 
 		 936 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.16 
 
 		 946 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.03 
 
 		 923 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.29 
 
 		 1023 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.21 
 
 		 954 aa  382  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.18 
 
 		 989 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.99 
 
 		 937 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.65 
 
 		 994 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.74 
 
 		 1006 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.4 
 
 		 995 aa  379  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.21 
 
 		 1002 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.36 
 
 		 1001 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 		 994 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.98 
 
 		 985 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.87 
 
 		 997 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.07 
 
 		 937 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.18 
 
 		 989 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.73 
 
 		 1002 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.57 
 
 		 931 aa  376  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.01 
 
 		 931 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.19 
 
 		 989 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.97 
 
 		 1088 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.12 
 
 		 1004 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.15 
 
 		 898 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  32 
 
 		 998 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.11 
 
 		 954 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.09 
 
 		 928 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.98 
 
 		 939 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.17 
 
 		 972 aa  373  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.11 
 
 		 1008 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.14 
 
 		 831 aa  369  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.79 
 
 		 1024 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.88 
 
 		 998 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 952 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>