289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0673 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  100 
 
 
354 aa  699    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  25.19 
 
 
401 aa  99.4  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.18 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  30.08 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  28.53 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  23.18 
 
 
393 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  26.56 
 
 
395 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  24.24 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  26.88 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  32.37 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  30.32 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  25.4 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  26.14 
 
 
584 aa  79.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  24.62 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  29.27 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  24.08 
 
 
436 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  26.82 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  23.55 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  26.56 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.65 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  23.55 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  23.55 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  30.17 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  30.43 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  30.43 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  34.46 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  31.06 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  24.86 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  29.81 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  23.8 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  25 
 
 
515 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  25.47 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.33 
 
 
660 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  25.96 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  24.79 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  24.8 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  26.11 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  26.78 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.04 
 
 
616 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  25.74 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  26.41 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  26.71 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  25.9 
 
 
615 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  32.43 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  25.21 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  25.14 
 
 
583 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  26.61 
 
 
404 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  27.75 
 
 
378 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  23.96 
 
 
430 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  23.18 
 
 
420 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  23.43 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  27.19 
 
 
395 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  24.41 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1288  acyltransferase 3  24.34 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.463574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  25.41 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  30.13 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2813  acyltransferase family protein  24.24 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3164  acyltransferase family protein  24.24 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1730  acyltransferase family protein  24.24 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  25.07 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0036  acyltransferase family protein  24.24 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  24.23 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  25.83 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3608  putative acyltransferase  24.24 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  24.39 
 
 
679 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3620  acyltransferase family protein  25.47 
 
 
400 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.775575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  23.43 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3633  putative acyltransferase  24.24 
 
 
372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  27.35 
 
 
333 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.6 
 
 
660 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44980  predicted protein  24.4 
 
 
492 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  26.25 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  24.93 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  26.74 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  25.08 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  20.17 
 
 
448 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  33.11 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  27.48 
 
 
592 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  29.94 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  22.8 
 
 
622 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  22.16 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  27.98 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  25.99 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  30.51 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  22.9 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  27.3 
 
 
359 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  26.39 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  23.56 
 
 
635 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  23.42 
 
 
353 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  26.37 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  22.46 
 
 
656 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  30.22 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  25.14 
 
 
478 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  25.54 
 
 
383 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  31.91 
 
 
352 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  23.64 
 
 
607 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.73 
 
 
657 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  28.93 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>