26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0671 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  906    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  67.21 
 
 
470 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  65.32 
 
 
468 aa  548  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  60.6 
 
 
450 aa  512  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1535  hypothetical protein  29.88 
 
 
432 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1440  hypothetical protein  27.06 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2423  hypothetical protein  27.06 
 
 
426 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  25.98 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0051  hypothetical protein  24.04 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0035  hypothetical protein  24.79 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0039  hypothetical protein  24.23 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0519  hypothetical protein  22.72 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0828452  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0037  hypothetical protein  24.34 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.434886  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1859  hypothetical protein  24.52 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1780  hypothetical protein  24.52 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2098  hypothetical protein  24.12 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  25.14 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  28.08 
 
 
549 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  28.8 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  21.73 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  28.16 
 
 
455 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  25.97 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  28.04 
 
 
441 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  22.92 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  30.46 
 
 
551 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  27.53 
 
 
572 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>