More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0650 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 256 aa  510  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.63 
 
 		 258 aa  351  5.9999999999999994e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.81 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.53 
 
 		 258 aa  328  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.27 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.28 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.14 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.87 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.67 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.6 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.04 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.03 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.06 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.87 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.42 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.42 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.72 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.6 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.52 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.47 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.8 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.2 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.82 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.74 
 
 		 266 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.6 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.62 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.42 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.91 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.91 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.91 
 
 		 264 aa  197  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.75 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.03 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.98 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 		 269 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.14 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.87 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.32 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.05 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.7 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.27 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 		 295 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.26 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.13 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.75 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.19 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.76 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.5 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.98 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.46 
 
 		 296 aa  188  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.06 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.18 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.7 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.75 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.67 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.32 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.04 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  44 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.42 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.75 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.73 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.68 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.8 
 
 		 294 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>