More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0573 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
404 aa  822    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  64.34 
 
 
410 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  56.11 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  38.73 
 
 
413 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
405 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
418 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
416 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
414 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
403 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
412 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  31.6 
 
 
417 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
422 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
411 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
420 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  31.08 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
406 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
411 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
408 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
403 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
517 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
412 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  29.64 
 
 
397 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
415 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
423 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
441 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
409 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
421 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  32.33 
 
 
417 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  29.52 
 
 
429 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
424 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
424 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
421 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
405 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  27.27 
 
 
406 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
409 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.96 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  25.48 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.96 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.96 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
408 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
407 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  26.62 
 
 
428 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.78 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  24.26 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  26.02 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
401 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
411 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
401 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  26.4 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  26.1 
 
 
421 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
412 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.82 
 
 
420 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
422 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  25.72 
 
 
407 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  25.72 
 
 
407 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
439 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  25.48 
 
 
407 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  25.48 
 
 
407 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  25.48 
 
 
407 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
423 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  24.36 
 
 
411 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.12 
 
 
416 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
436 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 
450 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  26.96 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  26.19 
 
 
435 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
427 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  25.54 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
402 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  24.94 
 
 
407 aa  96.3  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  23.87 
 
 
475 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
412 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  24.6 
 
 
388 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  27.2 
 
 
410 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
402 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  26.14 
 
 
370 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  25.53 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>