More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0501 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  70.13 
 
 
519 aa  759    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
519 aa  1060    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  70.31 
 
 
514 aa  759    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  72.18 
 
 
519 aa  769    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  63.39 
 
 
527 aa  685    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  61.85 
 
 
521 aa  668    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  69.69 
 
 
521 aa  746    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  38.13 
 
 
534 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  34.18 
 
 
570 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 
550 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  33.72 
 
 
513 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  32.38 
 
 
553 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 
545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 
545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  35.09 
 
 
549 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  31.7 
 
 
513 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  31.54 
 
 
544 aa  262  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  33.14 
 
 
531 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  31.51 
 
 
531 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  30.62 
 
 
549 aa  260  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  33.81 
 
 
531 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  31.42 
 
 
532 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  32.89 
 
 
531 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  32.43 
 
 
513 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  34.42 
 
 
544 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  34.11 
 
 
550 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  34.2 
 
 
544 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  32.29 
 
 
545 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  33.63 
 
 
548 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  29.85 
 
 
523 aa  243  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  31.66 
 
 
519 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  33.4 
 
 
557 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  33.54 
 
 
539 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.87 
 
 
505 aa  236  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  32.3 
 
 
519 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  31.65 
 
 
502 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.12 
 
 
500 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  31.52 
 
 
501 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  32.25 
 
 
511 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  29.88 
 
 
500 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  31.52 
 
 
510 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  32.38 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
506 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  26.18 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  28.17 
 
 
508 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  31.42 
 
 
501 aa  189  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  27.54 
 
 
520 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  27.7 
 
 
502 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.21 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.41 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  29.12 
 
 
502 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  30.43 
 
 
500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  28.19 
 
 
497 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  30.48 
 
 
500 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  30.05 
 
 
506 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  30.48 
 
 
500 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  34.21 
 
 
306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  30.02 
 
 
500 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  26.57 
 
 
501 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 
500 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 
505 aa  176  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  29.66 
 
 
500 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  31.85 
 
 
499 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
507 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  30.11 
 
 
500 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  30.34 
 
 
526 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  29.48 
 
 
503 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  29.48 
 
 
503 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  28.6 
 
 
501 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
504 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
509 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
504 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
504 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  29.59 
 
 
501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  29.88 
 
 
510 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  25.44 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  30.35 
 
 
519 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  30.35 
 
 
519 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  30.24 
 
 
504 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  30.24 
 
 
504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  29.27 
 
 
513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  28.45 
 
 
509 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  28.51 
 
 
501 aa  163  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  30.91 
 
 
511 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  30.12 
 
 
519 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  30.68 
 
 
511 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  30.92 
 
 
504 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  29.68 
 
 
506 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  28.23 
 
 
520 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  29.32 
 
 
510 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  31.8 
 
 
311 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.63 
 
 
500 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  32.27 
 
 
314 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>