More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0457 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 412 aa  818    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  75.68 
 
 		 407 aa  617  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  73.96 
 
 		 407 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  70.42 
 
 		 421 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  71.92 
 
 		 408 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  61.43 
 
 		 408 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  61.92 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  35.41 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  38.99 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.61 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  35.35 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  38.57 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  38.97 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  37.38 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  32.8 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 365 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  35.01 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  38.11 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.35 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  34.49 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.25 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  33.03 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 		 373 aa  209  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 366 aa  209  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.9 
 
 		 366 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  35.07 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.93 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.07 
 
 		 368 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.24 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  36.15 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.49 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.84 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  31.45 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  35.25 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.66 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.66 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.13 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.35 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.93 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.3 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.96 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.5 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.44 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  36.88 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  33.25 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  33.5 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  33.75 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  35.01 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.74 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  32.83 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  32.83 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  32.16 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0743  rod shape-determining protein RodA  31.9 
 
 		 438 aa  189  5.999999999999999e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0542496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  34.07 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  32.25 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  34.81 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 412 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.95 
 
 		 364 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  33.74 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  34.16 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  33.74 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  33.83 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  33.74 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  33.75 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  33.83 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>