More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0305 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  240  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  78.15 
 
 		 119 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  74.79 
 
 		 119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  78.15 
 
 		 119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  76.47 
 
 		 119 aa  189  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  53.78 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.13 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  56.6 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  52.88 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  53.78 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  53.54 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  47.86 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  50.45 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  53.92 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  50.45 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  47.11 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  51.85 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  49.12 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  52.1 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  54.72 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  48.31 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  53.77 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  46.34 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  52 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  49.12 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  45.19 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  51.38 
 
 		 122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  48.7 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  44.88 
 
 		 122 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  50.96 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  51.02 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  48.18 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  50 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  46.28 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  46.28 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  47.32 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  51 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  50.51 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  50.52 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  48.21 
 
 		 120 aa  103  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  44.17 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  50.96 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 		 122 aa  103  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  45.45 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  48.62 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  49.02 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>