More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0300 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 80 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  90 
 
 		 80 aa  144  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  87.5 
 
 		 80 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  85 
 
 		 80 aa  137  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  80 
 
 		 80 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  80 
 
 		 80 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  73.42 
 
 		 80 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  63.16 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  63.77 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  62.32 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  64.71 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  59.15 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  60.87 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  58.57 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  63.24 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  60.87 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  55.07 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  59.42 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  50.54 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  56.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  55.07 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  54.17 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  54.17 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  55.07 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  52.7 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  55.88 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  53.52 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  53.73 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  53.73 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  43.42 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  43.42 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0215  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 		 77 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 		 77 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  42.11 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  53.73 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  54.55 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  49.33 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>