36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0269 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  38.3 
 
 		 552 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  38.3 
 
 		 552 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  35.46 
 
 		 342 aa  97.1  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  34.75 
 
 		 290 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  29.17 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  36 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  34.34 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  33.66 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.19 
 
 		 584 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  32.29 
 
 		 942 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  30.93 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  32 
 
 		 851 aa  54.7  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  30.53 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  28.57 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  26.32 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  32 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  32.39 
 
 		 245 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  28.45 
 
 		 386 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  23.91 
 
 		 398 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.78 
 
 		 1266 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1283 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.61 
 
 		 490 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.97 
 
 		 517 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.39 
 
 		 137 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  23.91 
 
 		 398 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  27.59 
 
 		 384 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  26.6 
 
 		 299 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  28.38 
 
 		 541 aa  42  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  32.84 
 
 		 796 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  33.87 
 
 		 598 aa  41.6  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  29.21 
 
 		 566 aa  41.2  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>