More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0217 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 379 aa  785    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  89.18 
 
 		 379 aa  720    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  80.26 
 
 		 380 aa  656    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  83.64 
 
 		 379 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  88.92 
 
 		 379 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  43.47 
 
 		 384 aa  352  8e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  43.8 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  43.47 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  43.95 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  41.76 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.16 
 
 		 400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  43.06 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  42.05 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  42.18 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  40.9 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  40.64 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  40.37 
 
 		 384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  39.68 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.17 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.68 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.89 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.34 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  38.93 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  41.62 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.05 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  43.21 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  38.68 
 
 		 382 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  37.83 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.84 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  40.43 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  37.57 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.57 
 
 		 363 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  39.88 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  39.66 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  38.61 
 
 		 412 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  38.8 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.8 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  35.96 
 
 		 384 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.51 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.67 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.12 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.41 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  40.38 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.41 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  39.74 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.12 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  38.38 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  34.52 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  37.93 
 
 		 374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  35.73 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  33.94 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  40.06 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  35.88 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  37.46 
 
 		 360 aa  239  9e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  35.68 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  35.07 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  35.6 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  35.89 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  36.39 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  35.43 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  34.1 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  34.72 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  34.79 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  34.03 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  33.51 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  32.89 
 
 		 398 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  32.63 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  34.65 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  33.25 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  33.51 
 
 		 422 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  35.29 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  32.65 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  34.14 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  33.15 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  34.14 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  33.42 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.28 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  35.96 
 
 		 401 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  37.97 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  34.48 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  35.7 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  31.41 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  34.25 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  32.2 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  31.51 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  33.6 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  31.62 
 
 		 413 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  35.17 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>