More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0178 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 591 aa  1212    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  59.41 
 
 		 592 aa  701    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  62.93 
 
 		 582 aa  769    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  69.03 
 
 		 589 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.52 
 
 		 583 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.76 
 
 		 573 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  51.58 
 
 		 585 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  40.51 
 
 		 966 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  33.45 
 
 		 990 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 624 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.29 
 
 		 604 aa  300  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.74 
 
 		 1018 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 		 953 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.33 
 
 		 992 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 		 596 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  33.46 
 
 		 971 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1007 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.02 
 
 		 698 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  30.63 
 
 		 1012 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 		 997 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 537 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 		 976 aa  260  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.89 
 
 		 520 aa  260  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 		 600 aa  259  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.2 
 
 		 1003 aa  257  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.81 
 
 		 618 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.77 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.02 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30.76 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.42 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.42 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.33 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.39 
 
 		 1002 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.33 
 
 		 656 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 		 558 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.1 
 
 		 542 aa  225  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.12 
 
 		 543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.43 
 
 		 580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.16 
 
 		 427 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.62 
 
 		 631 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  35.98 
 
 		 538 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.95 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  31.15 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.05 
 
 		 541 aa  197  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  27.11 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.12 
 
 		 492 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.94 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  28.38 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.35 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.84 
 
 		 845 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.97 
 
 		 594 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  40.3 
 
 		 544 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.97 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.32 
 
 		 699 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  41.22 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.02 
 
 		 511 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 562 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.28 
 
 		 511 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.19 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  28.09 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 699 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  39.55 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.49 
 
 		 699 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  39.85 
 
 		 499 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  31.85 
 
 		 637 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  32.49 
 
 		 699 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.86 
 
 		 490 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 365 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.88 
 
 		 365 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.1 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  30.74 
 
 		 537 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.88 
 
 		 365 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 		 633 aa  170  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  27.91 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  28.96 
 
 		 528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  28.02 
 
 		 923 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  28.07 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.22 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  26.66 
 
 		 688 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.04 
 
 		 386 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.05 
 
 		 573 aa  161  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.71 
 
 		 412 aa  160  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  30.83 
 
 		 734 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.46 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  25.04 
 
 		 596 aa  158  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  26.72 
 
 		 759 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  39.91 
 
 		 468 aa  158  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  33.77 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  26.92 
 
 		 779 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  36.05 
 
 		 575 aa  153  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77156  glycosyl hyrolase family 3-like protein  31.62 
 
 		 1010 aa  153  8e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.354705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.27 
 
 		 499 aa  153  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  25.99 
 
 		 554 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  35.66 
 
 		 575 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  31.7 
 
 		 375 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>