170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0149 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  60.55 
 
 		 546 aa  661    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  58.92 
 
 		 540 aa  646    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1125  hydroxylamine reductase  76.57 
 
 		 542 aa  857    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000097703  normal  0.234741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  59.23 
 
 		 549 aa  661    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  81.48 
 
 		 540 aa  931    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  84.23 
 
 		 540 aa  952    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  61.06 
 
 		 547 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  58.91 
 
 		 568 aa  678    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  60.88 
 
 		 547 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0506  hydroxylamine reductase  79.7 
 
 		 542 aa  874    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  76.16 
 
 		 542 aa  835    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 542 aa  1117    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  81.67 
 
 		 540 aa  915    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  63.42 
 
 		 542 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  60.07 
 
 		 538 aa  644    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  64.44 
 
 		 553 aa  714    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  60.11 
 
 		 543 aa  659    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  61.81 
 
 		 591 aa  670    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  62.36 
 
 		 545 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  60.18 
 
 		 555 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  65.45 
 
 		 548 aa  715    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  61.74 
 
 		 546 aa  684    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  59.52 
 
 		 621 aa  656    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  65.15 
 
 		 549 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  60.33 
 
 		 547 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  59.1 
 
 		 555 aa  679    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  84.29 
 
 		 542 aa  947    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  56.06 
 
 		 551 aa  628  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  57.35 
 
 		 543 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  56.84 
 
 		 562 aa  611  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  56.01 
 
 		 538 aa  596  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  55.99 
 
 		 541 aa  586  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  54.86 
 
 		 552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  57.17 
 
 		 538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  53.32 
 
 		 539 aa  580  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  52.94 
 
 		 543 aa  579  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  47.7 
 
 		 533 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1523  hydroxylamine reductase  53.46 
 
 		 526 aa  511  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.53511  normal  0.352571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  47.88 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  47.97 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  47.79 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  47.15 
 
 		 533 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  47.15 
 
 		 533 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  45.59 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  44.7 
 
 		 547 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  47.63 
 
 		 542 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  47.34 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  44.92 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  47.06 
 
 		 537 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  47.26 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  43.67 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 		 545 aa  485  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  45.07 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  43.65 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  45.69 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  44.58 
 
 		 565 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  46.08 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  46.01 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  44.99 
 
 		 568 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  44.77 
 
 		 537 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  46.74 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  44.71 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  43.68 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  44.22 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  43.32 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  42.83 
 
 		 550 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  45.79 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  45.32 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  44.19 
 
 		 554 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  43.73 
 
 		 554 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  43.83 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  43.57 
 
 		 549 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  42.73 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  43.09 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  44.72 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  44.19 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  43.87 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  42.78 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  43.19 
 
 		 554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  42.55 
 
 		 554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  43.47 
 
 		 554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  44.82 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  42.12 
 
 		 554 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  43.73 
 
 		 554 aa  445  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  42.6 
 
 		 554 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  43.53 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  42.19 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  45.08 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  43.37 
 
 		 557 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  45.08 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  40.33 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  41.08 
 
 		 550 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  42.55 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  42.09 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  41.29 
 
 		 552 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  42.09 
 
 		 550 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  39.71 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  42.09 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>