More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0095 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  100 
 
 
131 aa  263  8e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.7247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  74.81 
 
 
131 aa  207  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  76.27 
 
 
131 aa  191  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  68.46 
 
 
147 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  75.57 
 
 
131 aa  187  3e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.01684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  70.4 
 
 
129 aa  186  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  70.09 
 
 
143 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  2.25979e-08  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  54.08 
 
 
191 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  51.96 
 
 
107 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  52.04 
 
 
198 aa  112  1e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  52.04 
 
 
198 aa  112  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  47.22 
 
 
158 aa  103  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.89548e-09  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  41.32 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.63767e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  45.37 
 
 
120 aa  99  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  44.95 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  47.57 
 
 
118 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.2805e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  43.14 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  44.76 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  3.65534e-11 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  44.44 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  43.4 
 
 
163 aa  95.9  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  47.37 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  8.07789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  47.06 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  43.81 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  4.18488e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  46.67 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  40.91 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.77061e-08  unclonable  8.96903e-09 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  43.75 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  48.98 
 
 
117 aa  94  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  5.88564e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  42.75 
 
 
125 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  2.5477e-09  unclonable  1.42145e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  42.39 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.27 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.07265e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.45 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.39024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  45.56 
 
 
118 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  36.36 
 
 
141 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  45.56 
 
 
118 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  44.34 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.56032e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  36.29 
 
 
122 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  43.31 
 
 
152 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  44.12 
 
 
142 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  45.83 
 
 
116 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.27491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  37.61 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  39.62 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.89424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  42.72 
 
 
118 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  41.76 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  42.53 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  38.46 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  43.33 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  44.09 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1521  Iojap-related protein  47.73 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  42.86 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  44.33 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  44.83 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  44.04 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  43.56 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  45.98 
 
 
173 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  43.01 
 
 
123 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  42.22 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  37.4 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  9.86152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  43.75 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  43.88 
 
 
110 aa  87.4  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  44.44 
 
 
120 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  41.75 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  37.38 
 
 
122 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  40.21 
 
 
144 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  37.38 
 
 
122 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  41.8 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  37.38 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  43.18 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0536  iojap-like protein  44.44 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  41.41 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  39.81 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  46.81 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  39.62 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  41.51 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  39.8 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  37.14 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  45.45 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  40.78 
 
 
114 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.45596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  39.81 
 
 
127 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  39.8 
 
 
117 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  43.62 
 
 
137 aa  84  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  5.82879e-11 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  39.56 
 
 
210 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  41.18 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  46.08 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  6.9668e-06  unclonable  1.98678e-10 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  43.68 
 
 
123 aa  82.8  1e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  39.81 
 
 
114 aa  83.2  1e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  42.39 
 
 
113 aa  82.8  1e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  38.18 
 
 
118 aa  82.8  1e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  6.67428e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  39.8 
 
 
132 aa  83.2  1e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  37.76 
 
 
159 aa  82.4  2e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  39.56 
 
 
135 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  40.66 
 
 
143 aa  82  2e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  37.5 
 
 
123 aa  82.4  2e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  36.63 
 
 
139 aa  81.6  3e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  38.83 
 
 
116 aa  82  3e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.06445e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  36.89 
 
 
166 aa  81.6  3e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  39.81 
 
 
132 aa  82  3e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  41.05 
 
 
119 aa  81.6  3e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  37.63 
 
 
137 aa  81.6  3e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  37.63 
 
 
121 aa  81.3  4e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  40 
 
 
158 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>