More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0088 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 185 aa  387  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  60.54 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  60.61 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  51.35 
 
 		 189 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  56.82 
 
 		 191 aa  210  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  47.37 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.4 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38.51 
 
 		 334 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  40.69 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  37.11 
 
 		 706 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  38.62 
 
 		 306 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.41 
 
 		 582 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.86 
 
 		 462 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 331 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  37.16 
 
 		 581 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 404 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  41.09 
 
 		 706 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  37.86 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.3 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  42.06 
 
 		 539 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 306 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.14 
 
 		 406 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.14 
 
 		 406 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 446 aa  87.8  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.41 
 
 		 308 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.81 
 
 		 219 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 617 aa  83.6  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  38.58 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 428 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  30.43 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.6 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  35.38 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  35.38 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1192 aa  78.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 279 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.96 
 
 		 746 aa  78.2  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.58 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.81 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 547 aa  74.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 371 aa  75.1  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.43 
 
 		 820 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.96 
 
 		 261 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 1827 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  31.65 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  39.52 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 		 1056 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 422 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 649 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.58 
 
 		 1240 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 		 988 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 605 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1276 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 		 1022 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 732 aa  67.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 556 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1276 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.84 
 
 		 778 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 515 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 1421 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.17 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.64 
 
 		 810 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 804 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 		 738 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 352 aa  65.1  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.58 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.7 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 878 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.31 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1168  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.703043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 458 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>