More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0073 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  88.22 
 
 
433 aa  808    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  69.91 
 
 
432 aa  643    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  69.91 
 
 
432 aa  644    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  83.76 
 
 
432 aa  771    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
433 aa  894    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  69.91 
 
 
432 aa  641    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  87.27 
 
 
433 aa  801    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  68.06 
 
 
432 aa  633  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  68.14 
 
 
433 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  67.52 
 
 
433 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  66.05 
 
 
433 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  65.66 
 
 
436 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  61.57 
 
 
432 aa  574  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  60.65 
 
 
434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  62.85 
 
 
435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  63.89 
 
 
441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  60.7 
 
 
434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  62.5 
 
 
439 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  60.97 
 
 
433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  63.83 
 
 
423 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  61.2 
 
 
433 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  61.63 
 
 
435 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  61.06 
 
 
435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  61.48 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  61.34 
 
 
432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  60.19 
 
 
434 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  60.42 
 
 
433 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  60.19 
 
 
434 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  61.34 
 
 
433 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  60.19 
 
 
434 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  61.25 
 
 
435 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 
434 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  59.4 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  57.41 
 
 
433 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  56.38 
 
 
434 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  55.92 
 
 
433 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  56.25 
 
 
434 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  55.68 
 
 
433 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  55.68 
 
 
433 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  55.92 
 
 
436 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  56.37 
 
 
438 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  54.65 
 
 
432 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  57.08 
 
 
433 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  58.6 
 
 
433 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  55.48 
 
 
435 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.61 
 
 
439 aa  498  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  54.15 
 
 
439 aa  494  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  58.13 
 
 
444 aa  497  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  53.92 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  54.5 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  52.9 
 
 
434 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  54.15 
 
 
437 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  55.9 
 
 
446 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 
433 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  52.56 
 
 
430 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  53.13 
 
 
434 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  52.9 
 
 
433 aa  482  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  54.98 
 
 
445 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  53 
 
 
433 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  55.56 
 
 
441 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 
434 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 
441 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  55.08 
 
 
441 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  54.88 
 
 
432 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  52.44 
 
 
432 aa  472  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  52.11 
 
 
444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  50.46 
 
 
436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  52.11 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  55.17 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  54.23 
 
 
433 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  50.93 
 
 
429 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 
434 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  52.8 
 
 
432 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  52.78 
 
 
428 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  52.34 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  52.08 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  51.88 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  52.58 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  52.8 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  52.8 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  52.36 
 
 
441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  52.83 
 
 
431 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  51.76 
 
 
444 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
429 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  52.71 
 
 
434 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
435 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  52.34 
 
 
432 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  52.34 
 
 
432 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  51.87 
 
 
432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  51.16 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  52.47 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  53.99 
 
 
436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  51.29 
 
 
434 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  52.36 
 
 
441 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  52.36 
 
 
441 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>