258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0047 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  100 
 
 
88 aa  175  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0020  ATP synthase F1, epsilon subunit  70.45 
 
 
88 aa  133  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  72.73 
 
 
88 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  69.32 
 
 
88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  69.32 
 
 
88 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0049  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  63.64 
 
 
88 aa  114  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.116999  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0030  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  62.5 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00561191  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  47.44 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  47.5 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  44.3 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0337  H+-transporting two-sector ATPase, epsilon subunit  46.25 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0911  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.42 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.31 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  44.16 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.26 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.03 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.47 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0818  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.56 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.46 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1028  hypothetical protein  41.03 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.44 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.75 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01405  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.78 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.25 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.16 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.04 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.65 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.65 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0256  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.65 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344579  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.59 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.97 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.799769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.97 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.24 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.92 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.93 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
132 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0959525 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
129 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
132 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
132 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
132 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.03 
 
 
139 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1563  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.73 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000113638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  35.06 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0328  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.66 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.82 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.44 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2377  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.44 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163402 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6061  ATP synthase F1, epsilon subunit  36 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.67 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.5 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
86 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  30.38 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.25 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.29 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.49 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.65 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  34.62 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.91 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>