71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0031 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  70.09 
 
 		 120 aa  174  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  69.42 
 
 		 121 aa  173  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  34.45 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  30.25 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  31.36 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  30 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  37.37 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  32.14 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  26.67 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  31.13 
 
 		 272 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  33.94 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  28.95 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  29.46 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  29.2 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  25.21 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  32.67 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  30.63 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  27.35 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  26.45 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  31.53 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  30.17 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  31.36 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  30 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  30.19 
 
 		 271 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  30.19 
 
 		 271 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  20.51 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  28.57 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  29.84 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  29.84 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  29.66 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  29.66 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  29.66 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  26.89 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0568  hypothetical protein  32.94 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000883944  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3852  hypothetical protein  29.89 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000776129 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  31.19 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  28.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  28.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  28.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  28.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  28.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  27.05 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3205  DsrE family protein  28.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  30.28 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  34.75 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3274  DsrE family protein  29.41 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  27.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  26.5 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  28.33 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  26.27 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  26.27 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  27.72 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  28.97 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0463  DsrE-like protein  31.82 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  28.71 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  24.37 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  26.47 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  26.47 
 
 		 114 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1129  DsrE family protein  25.83 
 
 		 117 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000155776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>