53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0020 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  100 
 
 
105 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  73.33 
 
 
105 aa  176  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  59.05 
 
 
110 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  58.1 
 
 
110 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  59.05 
 
 
109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  53.4 
 
 
111 aa  121  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  51.43 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  46.15 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  45.71 
 
 
110 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  45.71 
 
 
110 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  45.54 
 
 
110 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  42.86 
 
 
110 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  43.81 
 
 
118 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  44.23 
 
 
111 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  41.35 
 
 
110 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  40.38 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  41.35 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  51.95 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  51.95 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  41.35 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  40.38 
 
 
111 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  41.58 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  38.83 
 
 
117 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  38.83 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  39.05 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  40.2 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  32.69 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  43.04 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  36.27 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  36.27 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  39.18 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  33.01 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  36.19 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  27.88 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  47.76 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  27.88 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  39.39 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  34.29 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  30 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  30.1 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  30.1 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  37.1 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  26.47 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  26.47 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  26.47 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  26.47 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  28.7 
 
 
113 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  29.21 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  28.43 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  27.52 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  27.52 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  44.74 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  26.6 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>