166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1996 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  83.04 
 
 		 395 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  813    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  45.55 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  46.03 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  45.81 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  45.5 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  46.03 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  46.3 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  44.59 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  46.03 
 
 		 396 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  46.03 
 
 		 396 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  44.44 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  45.5 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  45.83 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  43.65 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  43.65 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  43.65 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  45.38 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  43.65 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  43.65 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  43.65 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  43.65 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  45.24 
 
 		 396 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  40.91 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  42.26 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  43.67 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  38.72 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  42.01 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  40.48 
 
 		 393 aa  272  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  39.24 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  38.1 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  38.68 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  39.07 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  36.22 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  37.08 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  35.62 
 
 		 451 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  35.62 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  36.76 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  36.39 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  35.09 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  38.87 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  35.22 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  38.59 
 
 		 404 aa  219  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  36.16 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  37.06 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  37.08 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  35.85 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  35.6 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  36.57 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  37.16 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  35.75 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  34.54 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  35.88 
 
 		 376 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  37.23 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  35.18 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  36.13 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.57 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.74 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  31.67 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.72 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  33.06 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  32.7 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.88 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  28.37 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.45 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  30.69 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  27.4 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  29.37 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.14 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  28.8 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  29.6 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  30.75 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  32.23 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  32.23 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  28.93 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  28.17 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  31.65 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  25.07 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.61 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  29.95 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.06 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  26.73 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  24.3 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.86 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  24.79 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  24.22 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  28.11 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.35 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  27.11 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  30.17 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  29.09 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  31.9 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  26.27 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  27.95 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  28.42 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  26.47 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>