More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1916 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 381 aa  785    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  76.38 
 
 		 381 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  47.31 
 
 		 369 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  45.48 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  46.11 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  46.4 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  45.18 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.63 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.3 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.36 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.36 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  45.82 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  43.87 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  45.82 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  45.82 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  46.09 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  46.09 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  46.09 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  46.09 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  46.26 
 
 		 353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.47 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.04 
 
 		 368 aa  288  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0295  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.09 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  44.23 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  49.82 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  44.2 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  44.47 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.85 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  42.47 
 
 		 350 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.9 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.21 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  50.38 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  50.94 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  50.77 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.5 
 
 		 357 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.38 
 
 		 348 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  50.38 
 
 		 368 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 350 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.6 
 
 		 344 aa  256  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  42.05 
 
 		 374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.29 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.81 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.75 
 
 		 353 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.43 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.26 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  52.27 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  50.38 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  49.06 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  44.48 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  41.69 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.81 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.36 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.79 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.98 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  49.81 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  49.43 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  49.06 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  49.06 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  49.06 
 
 		 363 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.53 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  49.06 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  39.73 
 
 		 349 aa  242  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.7 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  48.48 
 
 		 355 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  50.19 
 
 		 351 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  46.52 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.07 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  46.57 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  46.84 
 
 		 350 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  47.94 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  47.19 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  47.19 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  49.06 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  37 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  38.59 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  38.52 
 
 		 350 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  38.74 
 
 		 350 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  38.9 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  38.9 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  38.9 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  38.59 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  47.94 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  40.5 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  38.9 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.9 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.16 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  38.59 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.9 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  40.27 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  37.84 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  47.19 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  38.63 
 
 		 360 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.21 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  40.55 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>