More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1906 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  55.78 
 
 
656 aa  691  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  58.85 
 
 
668 aa  753  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  58.09 
 
 
668 aa  739  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  58.23 
 
 
663 aa  719  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  100 
 
 
660 aa  1315  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  58.09 
 
 
667 aa  726  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  58.07 
 
 
670 aa  729  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  53.42 
 
 
652 aa  643  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  58.09 
 
 
668 aa  739  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  58.07 
 
 
670 aa  729  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  58.05 
 
 
678 aa  742  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  65.2 
 
 
674 aa  860  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  91.67 
 
 
660 aa  1202  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  57.14 
 
 
665 aa  661  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  58.09 
 
 
668 aa  738  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  54.63 
 
 
664 aa  652  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  58.4 
 
 
667 aa  732  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  58.46 
 
 
666 aa  726  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  58.08 
 
 
663 aa  728  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  64.75 
 
 
659 aa  801  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  58.16 
 
 
669 aa  717  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.16 
 
 
669 aa  717  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  65.36 
 
 
659 aa  867  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  64.7 
 
 
659 aa  820  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  56.97 
 
 
680 aa  699  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  53.93 
 
 
661 aa  662  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  65.2 
 
 
659 aa  824  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  56.11 
 
 
661 aa  657  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.16 
 
 
669 aa  717  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.16 
 
 
669 aa  724  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.16 
 
 
669 aa  717  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  57.08 
 
 
661 aa  642  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  55.91 
 
 
661 aa  647  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.16 
 
 
669 aa  717  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  54.84 
 
 
661 aa  613  1e-174  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  53.91 
 
 
655 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  54.99 
 
 
661 aa  594  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  50.31 
 
 
658 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  47.23 
 
 
661 aa  518  1e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  47.23 
 
 
661 aa  518  1e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.12 
 
 
662 aa  459  1e-128  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  40.28 
 
 
650 aa  454  1e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.62 
 
 
654 aa  452  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  40.33 
 
 
648 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  40.33 
 
 
648 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  41.95 
 
 
648 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  37.18 
 
 
654 aa  435  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  41.52 
 
 
648 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  40.03 
 
 
648 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  41.52 
 
 
648 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.76 
 
 
648 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  39.63 
 
 
657 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  41.19 
 
 
649 aa  429  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  40.18 
 
 
648 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.44 
 
 
649 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 
666 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  40.57 
 
 
653 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  40.57 
 
 
649 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  39.46 
 
 
649 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.63 
 
 
655 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.9 
 
 
720 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.4 
 
 
648 aa  406  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  44.08 
 
 
570 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  41.64 
 
 
574 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 
658 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  37 
 
 
583 aa  340  6e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.52 
 
 
579 aa  337  3e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.25 
 
 
672 aa  328  2e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.89 
 
 
572 aa  327  3e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.31 
 
 
697 aa  327  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  35.42 
 
 
666 aa  323  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 
775 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 
665 aa  321  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 
664 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 
665 aa  314  3e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  33.02 
 
 
674 aa  313  7e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  36.75 
 
 
533 aa  313  7e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
762 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.17 
 
 
541 aa  307  4e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.17 
 
 
541 aa  307  4e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
666 aa  307  4e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 
666 aa  307  5e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.87 
 
 
578 aa  305  3e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  35.29 
 
 
569 aa  304  4e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.77 
 
 
541 aa  303  9e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  39.54 
 
 
594 aa  303  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  35.76 
 
 
668 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.9 
 
 
568 aa  301  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 
591 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 
590 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 
595 aa  300  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.91 
 
 
670 aa  300  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 
629 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  34.66 
 
 
666 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.91 
 
 
671 aa  297  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  38.34 
 
 
577 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  34.93 
 
 
589 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  30.67 
 
 
628 aa  295  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  34.93 
 
 
589 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  35.41 
 
 
593 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>