161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1887 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  71.22 
 
 		 140 aa  226  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000773894  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1591  OsmC family protein  89.17 
 
 		 130 aa  226  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277142  normal  0.616103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  69.78 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  69.78 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  69.78 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  69.06 
 
 		 140 aa  224  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  69.06 
 
 		 140 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  67.86 
 
 		 140 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  67.86 
 
 		 140 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  69.06 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  68.12 
 
 		 154 aa  222  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  69.78 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  69.06 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  69.06 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  69.06 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  68.35 
 
 		 140 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  68.35 
 
 		 154 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  67.63 
 
 		 140 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928304  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  68.12 
 
 		 140 aa  217  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  66.67 
 
 		 140 aa  213  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000203576  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  68.84 
 
 		 148 aa  208  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  68.18 
 
 		 133 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  67.39 
 
 		 148 aa  206  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  67.39 
 
 		 148 aa  206  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  65.96 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  67.39 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200026  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  65.94 
 
 		 139 aa  193  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  60.81 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000158569  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  63.01 
 
 		 149 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  61.22 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  59.18 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  60 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  59.18 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  61.31 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  58.5 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3415  OsmC family protein  65.94 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  60.54 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  58.39 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  58.27 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  57.97 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  59.29 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  58.27 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  59.29 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  58.27 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  58.27 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  59.85 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  58.27 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  56.83 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  56.12 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  56.52 
 
 		 138 aa  167  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  56.12 
 
 		 140 aa  166  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  57.97 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  57.55 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  56.2 
 
 		 154 aa  163  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  55.4 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  55.4 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  54.29 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  53.62 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  49.64 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  52.9 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  50.72 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  51.8 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  52.9 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  53.24 
 
 		 140 aa  146  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  52.52 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  52.52 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  53.62 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  52.52 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  51.8 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  52.52 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  52.17 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  52.17 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  53.28 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  53.28 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  49.63 
 
 		 140 aa  137  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  52.52 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  50.36 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  50.36 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  52.55 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1064  OsmC family protein  48.92 
 
 		 135 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.156075  normal  0.0776132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  40.58 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  45.32 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5001  OsmC family protein  48.85 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000117697  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  45 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2738  OsmC-like protein  44.6 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  43.31 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  44.12 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4022  OsmC-like protein  42.34 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  41.3 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>