More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1857 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  283  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  80.15 
 
 		 136 aa  240  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  54.96 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  53.96 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  49.23 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  53.54 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  52.76 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  51.97 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  51.24 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  47.24 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  50.83 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  51.28 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  58.95 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  48.74 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  49.59 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  49.18 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  48.76 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  49.19 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  49.18 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  46.46 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  46.49 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  45.69 
 
 		 128 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  43.33 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  45.61 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  46.36 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  42.06 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.82 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  41.12 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.22 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  50.7 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.61 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 344 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  34.92 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.17 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35.09 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  34.38 
 
 		 345 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.08 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  37.27 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  33.96 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.44 
 
 		 346 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  31.63 
 
 		 346 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.33 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  32.82 
 
 		 438 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.51 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  29.69 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.05 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  32.28 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  30.47 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.84 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.37 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 467 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.36 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.17 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  27.2 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  34.19 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  30.88 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  31.5 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 476 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 478 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.62 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.34 
 
 		 478 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.34 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  34.34 
 
 		 478 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>