More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1829 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  100 
 
 
236 aa  458  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  78.54 
 
 
234 aa  327  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0471  integral membrane protein TerC  67.26 
 
 
231 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0532  integral membrane protein TerC  67.7 
 
 
231 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0460  Integral membrane protein TerC  61.95 
 
 
231 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356096  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0476  Integral membrane protein TerC  61.5 
 
 
231 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  57.52 
 
 
233 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  54.78 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  52.02 
 
 
228 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  49.34 
 
 
234 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  48.03 
 
 
227 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  48.03 
 
 
227 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  46.44 
 
 
247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0556  hypothetical protein  60.79 
 
 
232 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
237 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  46.96 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  57.51 
 
 
230 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  49.78 
 
 
234 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  45 
 
 
237 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  51.85 
 
 
251 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  50.22 
 
 
234 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  46.32 
 
 
237 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  48.67 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  46.75 
 
 
244 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  50.79 
 
 
234 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  44.4 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  44.4 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  50.26 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  43.97 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  55.14 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  47.51 
 
 
243 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  51.83 
 
 
233 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  42.02 
 
 
243 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  44.12 
 
 
246 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  43.97 
 
 
230 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4030  integral membrane protein TerC  55.44 
 
 
243 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  54.92 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  41.13 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  49.46 
 
 
224 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5974  integral membrane protein TerC  50.79 
 
 
234 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  49.46 
 
 
224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  49.46 
 
 
224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  48.92 
 
 
224 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  48.92 
 
 
224 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  48.92 
 
 
224 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  47.85 
 
 
224 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  47.54 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  48.66 
 
 
237 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  47.31 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  47.72 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  40.61 
 
 
228 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  44.51 
 
 
229 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1506  integral membrane protein TerC  54.23 
 
 
249 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  41.74 
 
 
245 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  43.15 
 
 
225 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  41.74 
 
 
245 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1816  integral membrane protein TerC  39.24 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.34813  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  40.95 
 
 
239 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
228 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  44.68 
 
 
230 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  43.62 
 
 
230 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  45.45 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  45.45 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  45.45 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  45.99 
 
 
223 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  45.45 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  45.45 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  45.45 
 
 
224 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  45.45 
 
 
223 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  45.45 
 
 
224 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  45.23 
 
 
232 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2319  hypothetical protein  45.83 
 
 
282 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  46.91 
 
 
287 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  38.71 
 
 
219 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  46 
 
 
233 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  35.48 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  39.02 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  45.21 
 
 
230 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  41.57 
 
 
198 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  43.63 
 
 
346 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  42.33 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  41.8 
 
 
233 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  42.02 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  34.29 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 
258 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  40.1 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2121  hypothetical protein  41.09 
 
 
273 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  39.56 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5883  integral membrane protein TerC  48.39 
 
 
111 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>