More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1827 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 761 aa  1565    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 		 1094 aa  653    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  45.01 
 
 		 3560 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  48.14 
 
 		 3035 aa  730    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  44.99 
 
 		 4489 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  41.16 
 
 		 732 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 		 660 aa  492  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 		 618 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 909 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 		 750 aa  459  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 1085 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.87 
 
 		 816 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 647 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 740 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 654 aa  426  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 700 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 739 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 		 611 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 616 aa  354  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 569 aa  340  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 808 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  39.02 
 
 		 459 aa  323  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  40.78 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  36.29 
 
 		 560 aa  310  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  39.32 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 706 aa  300  9e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  50.72 
 
 		 295 aa  295  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  45.79 
 
 		 395 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.03 
 
 		 680 aa  293  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 574 aa  292  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  36.81 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 590 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  31.6 
 
 		 568 aa  280  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 		 750 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  39.04 
 
 		 657 aa  274  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  38.93 
 
 		 657 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  31.64 
 
 		 632 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 632 aa  257  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 828 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  36.83 
 
 		 633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 713 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 828 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 		 570 aa  250  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 672 aa  249  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.35 
 
 		 715 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  37.04 
 
 		 566 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 828 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 718 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 789 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 732 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1106 aa  230  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40.97 
 
 		 1276 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.9 
 
 		 739 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 824 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  33.87 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.16 
 
 		 1106 aa  227  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  34.18 
 
 		 637 aa  227  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.48 
 
 		 582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  30.64 
 
 		 588 aa  224  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.83 
 
 		 739 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.02 
 
 		 742 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 754 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 708 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 598 aa  217  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 754 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 619 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.25 
 
 		 739 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 968 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 626 aa  211  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 595 aa  210  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.69 
 
 		 740 aa  210  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 627 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.23 
 
 		 699 aa  204  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.73 
 
 		 708 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.87 
 
 		 585 aa  200  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 717 aa  198  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 647 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 734 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 717 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.03 
 
 		 1415 aa  190  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1714 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.51 
 
 		 529 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.08 
 
 		 1154 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 789 aa  184  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.35 
 
 		 1694 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.36 
 
 		 397 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  26.42 
 
 		 596 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 589 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 833 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 878 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 562 aa  177  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 667 aa  177  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.81 
 
 		 719 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  29.74 
 
 		 1596 aa  174  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 790 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 738 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  28.36 
 
 		 747 aa  172  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>