More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1792 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  95.68 
 
 		 324 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 324 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  79.94 
 
 		 322 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  78.33 
 
 		 323 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  78.02 
 
 		 324 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  77.78 
 
 		 323 aa  517  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  77.47 
 
 		 323 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  72.53 
 
 		 316 aa  477  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  72.22 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  72.22 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  72.53 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  72.22 
 
 		 316 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  72.53 
 
 		 316 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 316 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  72.22 
 
 		 316 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  72.53 
 
 		 316 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  72.53 
 
 		 316 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  71.6 
 
 		 316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  71.3 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 316 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  71.6 
 
 		 316 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  71.3 
 
 		 316 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  70.37 
 
 		 316 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4644  preprotein translocase subunit SecF  72.84 
 
 		 317 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3884  preprotein translocase subunit SecF  71.91 
 
 		 317 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0703005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  70.99 
 
 		 317 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  71.08 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  71.38 
 
 		 317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  71.38 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  66.57 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  64.55 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5118  preprotein translocase subunit SecF  69.44 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  65.19 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  65.27 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  64.22 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  62.9 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  57.14 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  55.95 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  43 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  43.73 
 
 		 313 aa  261  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  43 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  44.95 
 
 		 314 aa  258  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  44.48 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  42.45 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  45.03 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  42.49 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  43.89 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  41.8 
 
 		 315 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  40.69 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  40.38 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  42.38 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 304 aa  248  8e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  40.06 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  41.69 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  42.57 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  42.57 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  42.57 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  41.14 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  40.39 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  41.04 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  43.31 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  43.31 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  41.82 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  39.94 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  42.57 
 
 		 315 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  40.59 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  42.99 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  40.71 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  40.71 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  43.23 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  42.5 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  40.54 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  40.95 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  42.67 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  40.73 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  42.24 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  42.49 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  43.05 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  42.81 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  42.63 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>