More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1718 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  88.89 
 
 
81 aa  150  6e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  65.33 
 
 
75 aa  108  2e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  69.33 
 
 
75 aa  107  4e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  65.33 
 
 
75 aa  106  8e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  65.33 
 
 
75 aa  106  8e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  65.33 
 
 
75 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  58.67 
 
 
75 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  60 
 
 
75 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  60 
 
 
75 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  60 
 
 
75 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  60 
 
 
75 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  60 
 
 
75 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  58.67 
 
 
75 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  58.67 
 
 
75 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  57.14 
 
 
77 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  57.14 
 
 
77 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  59.72 
 
 
75 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  57.33 
 
 
75 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  57.69 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  62.5 
 
 
76 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  60.27 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  7.89219e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  56 
 
 
75 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  56 
 
 
75 aa  94.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  61.11 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  57.33 
 
 
75 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  56.76 
 
 
76 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  53.33 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.71633e-05  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  54.67 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  54.67 
 
 
75 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  53.33 
 
 
75 aa  90.5  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  54.79 
 
 
75 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  54.17 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  54.17 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  53.42 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  49.33 
 
 
76 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  49.3 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  6.89982e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  47.06 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  48.53 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17975e-07 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  49.28 
 
 
77 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  57.35 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  2.14154e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  45.59 
 
 
76 aa  82.8  1e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  45.59 
 
 
76 aa  82.8  1e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  46.05 
 
 
78 aa  83.2  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  45.59 
 
 
76 aa  82.8  1e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3042e-14 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  44.44 
 
 
77 aa  83.2  1e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  45.59 
 
 
75 aa  82.8  1e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  46.48 
 
 
74 aa  82.8  2e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  5.91857e-07 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  48.05 
 
 
82 aa  81.6  3e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  47.06 
 
 
75 aa  82  3e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  48.57 
 
 
78 aa  81.6  3e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  6.71264e-06  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  54.93 
 
 
76 aa  81.3  4e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  52.94 
 
 
77 aa  80.5  7e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  45.59 
 
 
76 aa  79  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.89 
 
 
189 aa  77.4  6e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  40.79 
 
 
78 aa  77.4  7e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  1.75689e-05  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  39.47 
 
 
186 aa  77  7e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.26035e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  39.47 
 
 
186 aa  77  8e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.25 
 
 
76 aa  76.6  1e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.19157e-05  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  36.84 
 
 
186 aa  76.3  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  42.5 
 
 
83 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  45.59 
 
 
75 aa  75.5  2e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  36.84 
 
 
186 aa  75.9  2e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  38.16 
 
 
186 aa  75.5  2e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.93639e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  36.84 
 
 
186 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47313e-12 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  44.58 
 
 
83 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69267e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  44.74 
 
 
79 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  46.48 
 
 
83 aa  75.1  3e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  41.89 
 
 
189 aa  75.1  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
186 aa  74.3  6e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  40.24 
 
 
83 aa  73.9  7e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  42.25 
 
 
103 aa  73.6  9e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  3.73287e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  40.24 
 
 
83 aa  73.6  9e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 
186 aa  73.6  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 
186 aa  73.6  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  37.5 
 
 
194 aa  72.4  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  42.65 
 
 
75 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.69274e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  42.5 
 
 
79 aa  72  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  42.65 
 
 
75 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.96514e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  41.56 
 
 
79 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  41.56 
 
 
79 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  41.56 
 
 
79 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  40.28 
 
 
75 aa  71.2  4e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  43.66 
 
 
79 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  49.23 
 
 
76 aa  70.1  9e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.95023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  38.24 
 
 
77 aa  67.4  7e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  40.28 
 
 
80 aa  67  8e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  66.6  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  39.44 
 
 
72 aa  66.2  2e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  38.89 
 
 
101 aa  66.2  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>