110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1655 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 333 aa  694    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  40.88 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  35.91 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  37.3 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.96 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  35.87 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  36.68 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.78 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  33.63 
 
 		 843 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  34.41 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  34.74 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  33.54 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  34.09 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  33.43 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  31.93 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 383 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 367 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  29.21 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  25.31 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.53 
 
 		 413 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.34 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  23.49 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  25.91 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.61 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  23.97 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.55 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  25.08 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  25.66 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  23.74 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  22.09 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.32 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  22.77 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  22.54 
 
 		 523 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  24.41 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  22.6 
 
 		 388 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  45.45 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.31 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  42 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  42 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  44.23 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  45.45 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  34.92 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  40.68 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  36.51 
 
 		 437 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10711  hypothetical protein  37.68 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25.38 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  43.75 
 
 		 647 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  43.75 
 
 		 647 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  37.88 
 
 		 546 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  38.1 
 
 		 549 aa  46.2  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  34.29 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  38.1 
 
 		 552 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  37.31 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  38.33 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  31.63 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  38.57 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  31.52 
 
 		 494 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  31.82 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  45.65 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  26.8 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  42.55 
 
 		 481 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  39.13 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10711  hypothetical protein  39.06 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  40 
 
 		 628 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  37.5 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  33.33 
 
 		 470 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  36.78 
 
 		 460 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  42.31 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>