177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1650 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.51 
 
 
209 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
223 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  39.61 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.56 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  38.54 
 
 
230 aa  161  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.68 
 
 
224 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.33 
 
 
234 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  40.57 
 
 
210 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.76 
 
 
215 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  36.76 
 
 
215 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  38.32 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.64 
 
 
222 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.15 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.44 
 
 
211 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  38.21 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  38.65 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  38.21 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.21 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.21 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.21 
 
 
211 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.21 
 
 
211 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.79 
 
 
190 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  34.72 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  38.34 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  36.41 
 
 
210 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  36.06 
 
 
200 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  38.25 
 
 
217 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  37.7 
 
 
217 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  32.66 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  32.99 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  36.36 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.61 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  35.16 
 
 
216 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.01 
 
 
191 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  35.29 
 
 
192 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  34.85 
 
 
196 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.5 
 
 
197 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  33.5 
 
 
197 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  33.84 
 
 
196 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  36.51 
 
 
196 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.17 
 
 
194 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.67 
 
 
196 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.96 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  32.32 
 
 
196 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.16 
 
 
183 aa  94.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.84 
 
 
196 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  32.49 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.95 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.65 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
196 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  30.96 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  34.02 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.21 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.21 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.02 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  32.02 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  32.02 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.14 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.14 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.14 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.14 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  32.02 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  40.18 
 
 
111 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  28.14 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  34.38 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.11 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  28.37 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.64 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  30.35 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  27.75 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.14 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.71 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  34.82 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.91 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.76 
 
 
182 aa  61.6  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  32.52 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.02 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  25.7 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.33 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  32.26 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.74 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  35.48 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.7 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  31.9 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  33.61 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  33.61 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  21.9 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  27.22 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>