60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1605 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  36.15 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  37.69 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  33.04 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  31.3 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.3 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.3 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  33.04 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  40.45 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  32.74 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.17 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  32.74 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.38 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  32.74 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  33.04 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.78 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.67 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  30.09 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.17 
 
 
293 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.44 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  34.19 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.82 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.33 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.07 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.07 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.95 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.07 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.9 
 
 
289 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.25 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.9 
 
 
289 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.9 
 
 
289 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.07 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.07 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.07 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  30.51 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  26.32 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  31.09 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  31.09 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  32.74 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.19 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  27.43 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.09 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1929  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.11 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.95 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.43 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  28.81 
 
 
139 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.55 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.72 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  28.32 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0904  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.92 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0521  hypothetical protein  27.96 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.63 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  24.55 
 
 
142 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>