148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1405 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  94.88 
 
 
215 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  59.53 
 
 
215 aa  268  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  56.74 
 
 
215 aa  265  3e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  58.6 
 
 
215 aa  264  9e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  58.6 
 
 
215 aa  264  9e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  58.14 
 
 
215 aa  262  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  57.67 
 
 
215 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  57.21 
 
 
215 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  57.48 
 
 
214 aa  257  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  56.74 
 
 
215 aa  254  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  53.95 
 
 
215 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  48.13 
 
 
208 aa  199  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  47.66 
 
 
208 aa  195  5e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  47.66 
 
 
208 aa  194  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  47.2 
 
 
208 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  47.2 
 
 
208 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  48.13 
 
 
208 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  47.2 
 
 
208 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  47.2 
 
 
208 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  47.2 
 
 
208 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  47.66 
 
 
208 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  46.26 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  46.73 
 
 
208 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  44.86 
 
 
208 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  41.4 
 
 
212 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.12514e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  42.06 
 
 
208 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  42.06 
 
 
208 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  41.59 
 
 
208 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  40.65 
 
 
208 aa  163  2e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  35.24 
 
 
205 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  33.81 
 
 
205 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  32.86 
 
 
205 aa  131  8e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
205 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  34.42 
 
 
211 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  128  5e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  35.05 
 
 
213 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  34.42 
 
 
211 aa  128  7e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  33.95 
 
 
211 aa  125  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  34.29 
 
 
209 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  33.18 
 
 
205 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  31.9 
 
 
206 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  33.96 
 
 
209 aa  120  2e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  32.86 
 
 
213 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  31.9 
 
 
209 aa  119  4e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  35.81 
 
 
209 aa  119  5e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  30.52 
 
 
214 aa  118  5e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  32.09 
 
 
211 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  31.19 
 
 
214 aa  114  8e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  32.87 
 
 
390 aa  114  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  30.81 
 
 
204 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  31.46 
 
 
217 aa  110  2e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  28.23 
 
 
206 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  34.74 
 
 
209 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  32.09 
 
 
214 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  30.84 
 
 
206 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  30.33 
 
 
208 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  5.48446e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  30.52 
 
 
209 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  30.95 
 
 
209 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 
207 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  31.63 
 
 
213 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  31.16 
 
 
213 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  28.7 
 
 
211 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  28.31 
 
 
212 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  30.33 
 
 
205 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0842  hypothetical protein  31.65 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  27.73 
 
 
210 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  29.38 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  31.73 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  28.5 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  29.41 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  31.16 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  28.44 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  29.77 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  31.31 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  33.14 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  28.37 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  33.14 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  28.5 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  29.3 
 
 
214 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  31.16 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>