285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1382 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  36.14 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  33.9 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  33.71 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  31.98 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  29.47 
 
 		 247 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  32.74 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  32.34 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 348 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  32.14 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.44 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 217 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  32.74 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.42 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  28.99 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 335 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  31.71 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 354 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  30.86 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 335 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.15 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 664 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  27.21 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  30.81 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  26.37 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 		 876 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  32.74 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  32.74 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  31.98 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  32.21 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  25.82 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 		 671 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.15 
 
 		 671 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  30.92 
 
 		 616 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  30.91 
 
 		 630 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.46 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  29.17 
 
 		 629 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  27.59 
 
 		 600 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  37.11 
 
 		 617 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.88 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.66 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  28.31 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.18 
 
 		 652 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  33.57 
 
 		 553 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  29.59 
 
 		 617 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.29 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  24.84 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.99 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.41 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>