31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1317 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  45.96 
 
 		 182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  40.11 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  40.11 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  43.5 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  39.56 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  39.56 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  38.55 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  42.26 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  33.14 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  31.67 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  31.9 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  31.29 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  26.62 
 
 		 482 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  24.32 
 
 		 484 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  34.88 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  28.04 
 
 		 508 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  29.56 
 
 		 508 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  29.56 
 
 		 508 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  31.25 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  27 
 
 		 499 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  40 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  30.43 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  36.99 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  35.63 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  35.63 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  38.75 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>