47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1273 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  41.51 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  41.51 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  42.86 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  35.79 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  35.79 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  33.66 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  40.57 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  30.1 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  41.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  41.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  41.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  38.1 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  38.1 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  32.04 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  28.71 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  37.11 
 
 		 109 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  34.91 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  31.76 
 
 		 107 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>