More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1252 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  79.72 
 
 		 288 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  63.77 
 
 		 275 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  61.73 
 
 		 269 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  62.68 
 
 		 265 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  61.45 
 
 		 269 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  62.18 
 
 		 269 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  63.04 
 
 		 258 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  62.32 
 
 		 258 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  59.71 
 
 		 258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 258 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 		 322 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  58.7 
 
 		 258 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  57.97 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  59.06 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  59.06 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  58.7 
 
 		 258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  57.61 
 
 		 271 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  57.61 
 
 		 272 aa  321  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  54.35 
 
 		 256 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  57.25 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  53.99 
 
 		 254 aa  295  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  52.9 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  52.54 
 
 		 258 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  51.09 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  51.64 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  48.73 
 
 		 261 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  48.19 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  49.64 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  52.17 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  49.28 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  49.28 
 
 		 258 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  49.28 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  50.18 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  49.28 
 
 		 255 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  49.82 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  48 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  47.83 
 
 		 258 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  49.82 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  49.45 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.1 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  47.1 
 
 		 255 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  47.48 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  45.05 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  46.93 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  46.21 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  46.57 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  45.56 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  41.94 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  43.06 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  41.43 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  41.61 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  40.93 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  45.96 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  45.96 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  40.29 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  39.21 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  41.01 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  39.36 
 
 		 262 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  39.36 
 
 		 262 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 260 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  38.85 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  42.5 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  42.55 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  40.88 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  39.86 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  42.96 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  37.68 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  37.59 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  36.86 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  35.74 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  38.63 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  35.87 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  37.63 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.27 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  39.78 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  36.9 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  36.07 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  36.59 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  36.75 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  36.65 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  38.41 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  38.57 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  38.04 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  37.99 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  37.94 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  38.91 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>