More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1182 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  74.81 
 
 
262 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  47.56 
 
 
257 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  45.88 
 
 
251 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
255 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
254 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
254 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 
254 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  45.16 
 
 
254 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  42.13 
 
 
257 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  43.2 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  43.65 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
267 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  44.44 
 
 
248 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
229 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  41.57 
 
 
263 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  44.76 
 
 
282 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  44.03 
 
 
285 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  43.48 
 
 
270 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
278 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  47 
 
 
260 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
270 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
270 aa  204  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
244 aa  204  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.16 
 
 
263 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.08 
 
 
270 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  48.2 
 
 
255 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  40.83 
 
 
288 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  42.37 
 
 
259 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  41.73 
 
 
280 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  43.82 
 
 
281 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  46.12 
 
 
270 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
267 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
264 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  45.66 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  42.54 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  41.27 
 
 
272 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  43.08 
 
 
274 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  45.2 
 
 
260 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.81 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.31 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  40.48 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  45.67 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  40.49 
 
 
285 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
288 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
288 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
288 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  42.74 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  40.87 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  44.92 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.16 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  40.94 
 
 
271 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
259 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  43.03 
 
 
275 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  41.77 
 
 
263 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
249 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  44.34 
 
 
281 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 
249 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
249 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 
249 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
249 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  44.34 
 
 
281 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  48.1 
 
 
275 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  40.81 
 
 
265 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  39.44 
 
 
260 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 
249 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  39.83 
 
 
272 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 
249 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0621  ABC transporter related  45.34 
 
 
246 aa  192  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
251 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  42.68 
 
 
274 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.21 
 
 
253 aa  191  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.77 
 
 
284 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.68 
 
 
272 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  40.73 
 
 
281 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 
249 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  47.4 
 
 
249 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  46.4 
 
 
254 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  39 
 
 
265 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  39 
 
 
265 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  39 
 
 
265 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  40.66 
 
 
269 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  38.71 
 
 
267 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  39 
 
 
265 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  40.16 
 
 
275 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  40.25 
 
 
259 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>