239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1178 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  63.6 
 
 		 272 aa  328  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  61.03 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  49.41 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  46.12 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  44.64 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  43.83 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  45.02 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  44.12 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  42.92 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  43.04 
 
 		 241 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  41.74 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  40.69 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  41.13 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  39.23 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  40.55 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  40.55 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  39.77 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  39.66 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  39.76 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  39.76 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  40.31 
 
 		 265 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  40.69 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  44.49 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  43.1 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  38.19 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  40.26 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  42.39 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  38.27 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  40.78 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  36.25 
 
 		 263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  40.31 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  38.25 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  38.63 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  43.25 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  42.19 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  39.18 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  40.82 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  41.45 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  42.46 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  38.27 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  39.57 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  39.44 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  36.8 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  37.84 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  38.33 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  36.75 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  37.5 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  39.15 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  40.49 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  37.92 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  38.17 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  33.77 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  39.58 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  38.31 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  39.58 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  39.58 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  35.91 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  38.5 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  40.42 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  32.21 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  40.42 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  38.93 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  32.93 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  33.21 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  39.58 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  32.13 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  40.17 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  31.95 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  34.66 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31.11 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.76 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  37.05 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  35.62 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  37.56 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  36.79 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  36.2 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  31.03 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  32.95 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  34.1 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  35.6 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  35.94 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  32.18 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  33.05 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  31.47 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  31.84 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  36.29 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  27.66 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  31.25 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>