12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1113 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.341492  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  46.02 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0688  hypothetical protein  47.96 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41590  hypothetical protein  51.16 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3361  regulatory protein, MarR  50.6 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52410  hypothetical protein  51.16 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3127  hypothetical protein  45.35 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  decreased coverage  0.00835036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2353  hypothetical protein  38.53 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  26.61 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  30.49 
 
 		 134 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  27.88 
 
 		 120 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>